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几内亚确定了三种埃博拉病毒变种

发布时间:2019-12-27 15:32:28 来源:

对在几内亚传播的埃博拉病毒株的基因组进行测序,使达喀尔和巴黎巴斯德研究所,CNRS和悉尼大学的科学家得以追溯该病毒的传播并监测其在爆发爆发的国家的演变。这项研究揭示了在几内亚,特别是在首都和邻近城镇的城市中,该病毒的三种不同变体的共同传播,该变体的突变在《自然》杂志上发表。病毒遗传变异的表征对于确保诊断工具的持续有效性以及开发有效的治疗方法和疫苗至关重要。

埃博拉疫情在西非持续进行了一年多,报道的病例有27341例,其中11184例是致命的。流行的根源可追溯到几内亚东南部的一个森林地区,并从那里迅速蔓延到首都科纳克里和周边国家。2014年3月,达喀尔巴斯德研究所在Donka医院(科纳克里)建立了一个流动实验室,为整个几内亚提供诊断服务。在整个流行期间,巴斯德研究所及其网络在科纳克里和几内亚其他地区(例如马肯塔)的志愿者的参与是恒定的。

监测埃博拉病毒基因组的发展对于制定更好的治疗策略,设计有效的疫苗并确保诊断工具的持续有效性至关重要。为此,达喀尔和巴黎巴斯德研究所,CNRS和悉尼大学的科学家通过表征2014年7月至11月在几内亚传播的埃博拉病毒分离株,为国际抗击该疾病做出了贡献。

与已经部署在塞拉利昂的布罗德研究所(美国剑桥)的科学家合作,优化了仅包含少量生物材料的稀有样品中病毒的测序。对这些序列的分析揭示了该病毒在几内亚共同传播的三个不同变体的存在,其动态与在塞拉利昂和利比里亚观察到的非常不同。

第一个变体(GUI-1-在地图上以红色显示)与2014年3月流行开始时采样的病毒密切相关。此变体仅在几内亚的市区(科纳克里)和林区中发现。

第二种变体(GUI-2-在地图上以蓝色显示)与塞拉利昂境内传播的病毒有关,但可能对应于几内亚的平行进化。这些序列代表缺失的环节,导致在2014年10月和2014年11月在马里两次引入埃博拉病毒。

在科纳克里和周边城镇(Forecariah,Dalaba和Coyah)中发现了第三个变体(SLE-GUI-3-在地图上以橙色显示)。该变种与塞拉利昂发现的病毒之间的显着相似性,再加上流行病学数据,突显了从塞拉利昂向科纳克里周围地区多次引入埃博拉病毒。

每个变体由影响不同病毒蛋白,特别是VP35蛋白(可能是一种致病因子),病毒包膜糖蛋白(可能会改变免疫系统对病毒或聚合酶的感知)的突变的组合定义。更保守的病毒区域。

尽管这项研究突出了该流行病传播期间在几内亚传播的病毒的遗传多样性,但它也表明突变率完全在先前针对此类病毒描述的范围内。监测病毒变异是流行病学研究(追溯传播链)的有力补充,并且可以在潜在的新流行病发生时更好地确定应对策略。最后,对埃博拉病毒遗传变异的研究已迅速提供给科学界,这将有助于优化正在开发的治疗方法和疫苗。

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